（一）投资绩效审计程序的内涵。审计程序是审计机构和审计人员为达到审计目标所采取的所有工作步骤的总和。研究审计程序需要解决三个问题:一是审计程序的一般规律;二是影响审计程序制定的制约因素;三是不同类型审计其审计程序的特点。由于国家审计机关、民间审计组织和内部审计机构对审计程序的要求不同，又由于我国有关法律和准则对审计程序也没有下完整准确的定义，因此人们对审计程序有不同的理解。
许多国家和国际组织的法律和准则都将审计程序理解为审计机构和审计人员接受审计任务后，组织审计资源、完成审计任务的全过程，包括准备阶段、实施阶段和报告阶段。这种理解的特点是，只关注与审计项目具体实施有关的工作环节。也有些国家还包括制定审计项目计划和后续审计的审计程序。
投资绩效审计程序与其他各种审计程序基本上是一致的，是使审计工作能够按照科学合理的轨迹有序运转的保证。在审计过程中，审计人员要根据所确定的审计目标和可支配的审计资源，针对具体的审计事项取得具有充分证明力的审计证据，依据审计证据去证实审计事项与审计依据的相符程度，就审计事项的性质作出审计结论，并将审计结果传达给利益相关的人。但在各个程序的具体运用中也有别于一般的常规审计，如：投资工程造价审核后还需征求施工单位意见，便于审计决定的整改落实。
（二）规范投资绩效审计程序的意义。投资绩效审计程序是保证实现审计目标的手段。只有设计并遵循合理、科学的审计程序，审计人员才能收集到具有充分证明力的审计证据，对审计事项进行审计评价，审计程序是确定审计方法的前提。只有先确定出科学、合理和规范的程序，审计人员才能选定适用的审计方法，高效地实施审计。规范投资绩效审计程序具有非常重要的意义。
1.规范投资绩效审计程序是保证审计质量、降低审计风险的客观要求。只有设计出完善的、符合实际要求的审计程序，才能将保证审计质量、降低审计风险的要求落实到审计工作各阶段、各环节和各步骤的始终。
2.规范投资绩效审计程序是提高审计效率、减少资源消耗的有效途径。只有严格而又灵活的审计程序，才能将理论的或法定的程序与审计人员的经验和职业判断有机结合起来，最大限度地提高审计工作效率。
3.规范投资绩效审计程序是依法审计、保障审计人员和被审计单位合法权益的手段。审计人员应该依照法定审计程序来实施，只有这样才能在可能发生的争议或诉讼中确定出一方的责任，保护另一方的利益。严格执行审计程序是审计工作规范化的要求。无论是国家审计、民间审计还是内部审计，对审计程序都有某些特殊的要求，其目的都是要通过规范投资绩效审计程序，来提高审计质量，维护职业信誉，树立职业形象。
(三)投资绩效审计程序的基本内容。20世纪后半叶，世界各国在审计理论和实务方面的研究都取得了一定的发展，审计准则的国际协调也取得了长足的进步。在这种背景下，不同类型的审计机构对标准审计程序的认识也在逐步加深。
现以国家审计为例，我国国家审计机关的投资绩效审计程序与民间审计和内部审计相比，具有较强的强制性，是法定程序，灵活性较差。《国家审计基本准则》以及相关的国家审计具体准则是我国国家审计程序的主要依据。《国家审计基本准则》明确要求“审计机关应当按照《审计法》及其实施条例，以及其他有关法律，法规规定的职责、权限和程序，独立行使审计监督权”、“作业准则是审计机关和审计人员在审计计划、准备和实施阶段应当遵循的行为规范”、“报告准则是审计组反映审计结果、提出审计报告以及审计机关审定审计报告时应当遵循的行为规范”、“审计报告处理准则是审计机关审定审计报告后，对审计事项作出评价，出具审计报告，对违反国家规定的财政收支、财务收支行为以及违反《审计法》的行为，作出处理、处罚的审计决定，或者提出审计建议以及报告审计工作时应当遵循的行为规范”。具体表现为：
1.制定审计项目计划。审计机关应根据国家形势和审计工作实际，对一定时期的审计工作目标任务、内容重点、保证措施等进行事前安排，作出审计项目计划。
2.审计准备。根据审计项目计划确定的审计事项组成审计组，并应当在实施审计三日前，向被审计单位送达审计通知书；遇有特殊情况，经本级人民政府批准，审计机关可以直接持审计通知书实施审计。上级审计机关对统一组织的审计项目应当编制审计工作方案，每个审计组实施审计前应当进行审前调查，编制具体的审计实施方案。
3.审计实施。审计人员通过审查会计凭证、会计账簿、财务会计报告，查阅与审计事项有关的文件、资料，检查现金、实物、有价证券，向有关单位和个人调查等方式进行审计，取得证明材料，并按规定编写审计日记，编制审计工作底稿。
4.报告阶段。审计组对审计事项实施审计后，应当向审计机关提出审计组的审计报告。审计组的审计报告报送审计机关前，应当征求被审计对象及相关的意见。审计机关对审计组的审计报告进行审议，提出审计机关的审计报告；对违反国家规定的财政收支、财务收支行为，依法应当给予处理、处罚的，在法定职权范围内作出审计决定或者向有关主管机关提出处理、处罚的意见。
5.后续审计程序。主要对审计机关所作出的处理、处罚的执行及听证和复议等进行了具体的要求。
（四）设计投资绩效审计程序时需要考虑的几个因素。在通用审计程序的基础上，具体投资绩效审计程序的设计必须考虑审计目标、审计主体、审计资源、审计客体和审计手段等一系列制约因素。审计机构和审计人员只有全面把握各种制约因素对审计程序的影响方式和影响程度，才能有针对性地设计出科学合理的投资绩效审计程序。
1.审计目标。审计目标是影响审计程序设计的重要因素。众所周知，程序只是实现目标的途径，不同的审计目标的实现要求有相应的审计程序来保证。例如，真实性审计目标主要体现在常规财务审计或财务报表审计之中。但单纯以效益性为审计目标的项目中，审计人员要单独设计出绩效审计程序。虽然绩效审计也要包括审计准备、审计实施和审计报告三个阶段，但每个阶段的内容都有很大的区别。
2.审计主体。审计主体是指审计工作的执行者，主要包括从事审计工作的审计机构及其审计人员。国家审计机关、民间审计组织和内部审计机构是三种不同的审计主体。不同的审计主体对审计程序有不同的特殊要求。例如：国家审计机关的审计程序受法律、法规制约较多，许多程序属于法定程序。我国的国家审计还具有审计处理、处罚权，与之相配套的行政复议、诉讼和听证等程序更是具有特殊性。
3.审计资源。审计资源是指国家审计机关、民间审计组织或内部审计机构可以用来完成特定审计任务的人力、财力和时间的总称。审计资源是影响审计程序设计的重要因素。充足的审计资源可以保证各类审计机构按照最理想的模式和需要选择和安排审计程序。审计资源不足时，各类审计机构就必须在保证资源最佳配置的前提下，慎重选择最基本的审计程序。当审计资源严重不足时，各类审计机构必须考虑承接审计任务后可能面对的风险和困难。通常情况下，各类审计机构均应避免在审计资源严重不足时接受审计任务或接受审计客户。
4.审计客体。不同规模的被审计单位或审计事项，对审计资源的需求不同，审计机构在设计审计程序时，也要在考虑成本效益的前提下，制定出详略得当的审计程序。
5.审计手段。审计手段对审计程序的影响巨大。审计手段的改变有时可以引起审计程序和审计方法的变革。
6.不同审计机构对审计程序的特殊要求。在通用审计程序的基础上，结合不同审计目标对审计程序的特殊要求，再考虑不同审计机构对审计程序的特殊要求，才能合理地设计出适用的审计程序。例如：国家审计非常强调下发审计通知书，《审计法》明确规定，“审计机关根据审计项目计划确定的审计事项组成审计组，并应当在实施审计三日前，向被审计单位送达审计通知书”等。
我们在选择投资绩效审计项目时，还应该考虑的以下几个因素:(1)预计的审计效果;(2)资金规模;(3)管理风险；(4)影响力；（5）审计成本和可操作性。一般来说，对预计审计效果大、资金规模大、管理风险大、影响力强、审计成本和可操作性强的投资项目，投资绩效审计的成效最佳。如果违背了投资绩效审计程序，就会影响审计效果，甚至会带来一定的审计风险；反之亦然。
案例：原告作为国家建设项目—某市市政广场灯具照明工程承揽方的上海沪陈灯具制造有限公司，以自己是国内合资企业不是国家审计的监督对象、审计机关没有向此项工程原审价机构调查取证违反法定程序为由，对某市审计局对其拒绝配合审计调查、拒不提供审计资料的违法行为依法作出48000元的行政处罚不服提起上诉。2007年1月22日，浙江省某市中级人民法院就原告上海沪陈灯具制造有限公司所诉审计行政处罚一案作出终审判决：某市审计局作出的审计行政处罚决定认定事实清楚，适用法律得当，程序合法，依法应予维持。上海沪陈灯具制造有限公司拒绝提供审计资料的行为违法，应依法接受审计机关的行政处罚。至此，全国首例因被审单位拒绝提供审计资料而提起的审计行政处罚案件有了定论。
